2018年9月25日，北京博奧晶典生物技術(shù)有限公司（以下簡(jiǎn)稱“博奧晶典”）攜手BD（中國(guó)）（以下簡(jiǎn)稱“BD”） 成立的博奧晶典—BD（中國(guó)）單細(xì)胞研究聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室舉行揭牌儀式，并簽署戰(zhàn)略合作協(xié)議。BD全球市場(chǎng)總監(jiān)Nikhil Rao，BD大中華區(qū)基因組業(yè)務(wù)部負(fù)責(zé)人於莉，BD基因組產(chǎn)品經(jīng)理武鑫，博奧晶典產(chǎn)品研發(fā)中心技術(shù)總監(jiān)潘良斌博士，博奧晶典科研服務(wù)事業(yè)部總經(jīng)理孟晨等出席揭牌儀式。
簽約儀式上，BD全球市場(chǎng)總監(jiān)Nikhil Rao與博奧晶典產(chǎn)品研發(fā)中心技術(shù)總監(jiān)潘良斌博士為實(shí)驗(yàn)室成立進(jìn)行了揭牌儀式并簽約，該實(shí)驗(yàn)室的建立旨在單細(xì)胞研究領(lǐng)域開(kāi)展合作，共推單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)進(jìn)入臨床轉(zhuǎn)化新時(shí)代。
博奧晶典-BD（中國(guó)）單細(xì)胞研究聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室，匯集了BD的Rhapsody單細(xì)胞測(cè)序分析系統(tǒng)，博奧晶典的單細(xì)胞懸液制備體系和生物信息研究院團(tuán)隊(duì)，依托BD（中國(guó)）與博奧晶典多年臨床轉(zhuǎn)化的經(jīng)驗(yàn)，為單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)進(jìn)入臨床轉(zhuǎn)化準(zhǔn)備好了天時(shí)、地利、人和的沃土。聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室基于單細(xì)胞檢測(cè)技術(shù)，開(kāi)展單細(xì)胞靶向基因測(cè)序、單細(xì)胞蛋白檢測(cè)、TCR/BCR檢測(cè)， 共同開(kāi)發(fā)國(guó)際一流的用于腫瘤、心血管疾病診療應(yīng)用的單細(xì)胞檢測(cè)panel，為疾病診斷、預(yù)后評(píng)估等提供有效參考。
單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)臨床轉(zhuǎn)化
2009年單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)問(wèn)世，2015年及以后隨著Drop-seq、Micro-well、Split-seq等技術(shù)的出現(xiàn)，徹底降低了單細(xì)胞測(cè)序的成本門(mén)檻。單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)被廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)科研和臨床研究，相應(yīng)成果也備受CNS青睞，如雨后春筍般頻頻出現(xiàn)在高分雜志。單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的研究成果涉及到腫瘤分型、靶向用藥、免疫治療，動(dòng)植物胚胎發(fā)育，心血管疾病的發(fā)生發(fā)展機(jī)制等眾多領(lǐng)域。
2017年，作為單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)臨床應(yīng)用的拓荒者，耶魯大學(xué)樊榮教授將單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)應(yīng)用于CART-T治療的監(jiān)測(cè)，他指出，“通過(guò)單細(xì)胞水平的檢測(cè)，預(yù)測(cè)腫瘤的發(fā)展趨勢(shì)，我們就有機(jī)會(huì)從整體水平上為患者制定更好的治療方案?！睘槲覀儗渭?xì)胞測(cè)序技術(shù)應(yīng)用于臨床帶來(lái)了思路和方向。
Rhapsody采用“分子標(biāo)簽”技術(shù)，基于微孔的原理，其卡式芯片可以在寡核苷酸條形碼標(biāo)記的磁性微球上，實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞捕獲和mRNA的反轉(zhuǎn)錄。然后通過(guò)磁鐵將這些微球吸出合并到單個(gè)管中用于cDNA擴(kuò)增和文庫(kù)構(gòu)建。構(gòu)建好的文庫(kù)使用Illumina測(cè)序平臺(tái)對(duì)文庫(kù)進(jìn)行測(cè)序檢測(cè)，即可一次性獲得100~10000個(gè)單細(xì)胞的基因表達(dá)數(shù)據(jù)，從而實(shí)現(xiàn)在單細(xì)胞水平進(jìn)行基因表達(dá)測(cè)序的目的。
BD Raphsody單細(xì)胞分選原理
Rhapsody 三大優(yōu)勢(shì)助力臨床轉(zhuǎn)化
1、每個(gè)panel可以選擇100~1000個(gè)靶向基因，靈活訂制。
靶向方法有助于提高單細(xì)胞測(cè)序效率，并推動(dòng)對(duì)當(dāng)今一些最具挑戰(zhàn)性的科學(xué)領(lǐng)域的進(jìn)一步探索。經(jīng)驗(yàn)證的檢測(cè)試劑盒（panel）顯示穩(wěn)定且可重現(xiàn)的細(xì)胞異質(zhì)性陣列，可用于探索與眾多應(yīng)用相關(guān)的細(xì)胞類(lèi)型。用戶可根據(jù)需求定制引物，將檢測(cè)范圍集中在目標(biāo)基因，大幅降低后續(xù)測(cè)序成本。目前已經(jīng)推出了乳腺癌、免疫反應(yīng)和T細(xì)胞三個(gè)靶向基因的檢測(cè)Panel。
BD 單細(xì)胞靶向基因捕獲原理
2、樣品標(biāo)記技術(shù)提高樣品通量、同時(shí)降低建庫(kù)成本。
Raphsody系統(tǒng)通過(guò)細(xì)胞表面通用蛋白的抗體與細(xì)胞表面的蛋白進(jìn)行反應(yīng)， 抗體的尾端加了一段樣品標(biāo)簽和polyA組成的核酸序列（圖3），此段核酸序列與單個(gè)細(xì)胞的mRNA一起進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄和測(cè)序。在得到測(cè)序數(shù)據(jù)后通過(guò)分析樣品標(biāo)簽序列，從而對(duì)細(xì)胞進(jìn)行樣品來(lái)源的追蹤。
基于該檢測(cè)原理，一次實(shí)驗(yàn)最多可以同時(shí)混合12個(gè)樣品進(jìn)行單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)，大大降低了單細(xì)胞測(cè)序的建庫(kù)費(fèi)用，進(jìn)而降低了科研成本。
樣品標(biāo)記的原理
3、轉(zhuǎn)錄組與蛋白的聯(lián)合研究，單細(xì)胞多組學(xué)研究的開(kāi)創(chuàng)性技術(shù)。
mRNA在翻譯成蛋白的過(guò)程，往往會(huì)發(fā)生轉(zhuǎn)錄后調(diào)控，而出現(xiàn)mRNA的變化趨勢(shì)與蛋白不一致甚至相反的趨勢(shì)。同時(shí)進(jìn)行mRNA與蛋白的聯(lián)合檢測(cè)有利于我們更為完善的檢測(cè)細(xì)胞內(nèi)的分子信息，尋找到轉(zhuǎn)錄后調(diào)控的信息、mRNA的可變剪切信息、并通過(guò)2種分子的聯(lián)合檢測(cè)進(jìn)一步提高細(xì)胞分群的解析度。
其檢測(cè)原理主要是通過(guò)多種帶有核酸序列的抗體與細(xì)胞同時(shí)發(fā)生反應(yīng)，帶有相應(yīng)蛋白的細(xì)胞表面通過(guò)抗原抗體特異性結(jié)合作用而結(jié)合了相應(yīng)的抗體，接下來(lái)對(duì)結(jié)合在細(xì)胞表面的抗體尾端的核酸序列和mRNA同時(shí)進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建和測(cè)序工作。拿到測(cè)序數(shù)據(jù)后，通過(guò)數(shù)據(jù)分析抗體尾端核酸序列的信息，來(lái)獲取單個(gè)細(xì)胞表面蛋白的信息，通過(guò)分析mRNA文庫(kù)信息，獲取單個(gè)細(xì)胞內(nèi)基因表達(dá)的信息，從而實(shí)現(xiàn)同時(shí)獲取單個(gè)細(xì)胞內(nèi)mRNA和細(xì)胞表面蛋白的信息的目的。
單細(xì)胞mRNA與蛋白聯(lián)合檢測(cè)原理
