近日，由北京博奧晶典生物技術(shù)技術(shù)有限公司（博奧晶典）與Affymetrix公司聯(lián)合主辦的“分子育種創(chuàng)新論壇——新技術(shù)與新進(jìn)展研討會(huì)”在北京希爾頓酒店隆重舉行。百余名來自中國科學(xué)院，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院，中國農(nóng)業(yè)大學(xué)、南京農(nóng)業(yè)大學(xué)、鄭州煙草研究院等單位的育種專家學(xué)者出席了此次會(huì)議。
北京博奧晶典生物技術(shù)有限公司總裁許俊泉為大會(huì)致開幕辭。許俊泉表示植物分子生物學(xué)技術(shù)一直在不斷地飛速發(fā)展，與此同時(shí)，生物芯片、二代測序等高通量分子檢測技術(shù)的應(yīng)用給作物育種帶來了前所未有的機(jī)遇和挑戰(zhàn)，以雜交為基礎(chǔ)的傳統(tǒng)育種方式將轉(zhuǎn)向更精準(zhǔn)、高效的分子標(biāo)記輔助育種方式。尋找和開發(fā)與優(yōu)勢性狀緊密連鎖的分子標(biāo)記，選擇合適的檢測手段或一體化解決方案，將成為實(shí)現(xiàn)分子標(biāo)記輔助育種的關(guān)鍵。主辦方希望通過本次論壇，為各位專家及廣大育種工作者提供一個(gè)分子育種最新技術(shù)與進(jìn)展的多方交流平臺(tái)，共同推進(jìn)農(nóng)業(yè)育種的產(chǎn)學(xué)研進(jìn)程。中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所研究員、國家“千人計(jì)劃”特聘專家徐云碧教授受邀主持此次論壇。
此次論壇特約8位會(huì)議專題報(bào)告嘉賓，他們分別是：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院賈繼增研究員，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所徐云碧研究員，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所黎志康課題組王文生副研究員，中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所田志喜研究員，南京農(nóng)業(yè)大學(xué)作物遺傳育種國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室喻德躍教授，北京博奧晶典生物技術(shù)有限公司生命科學(xué)服務(wù)部秦文彥主任，Affymetrix產(chǎn)品經(jīng)理王錢潔博士，北京博奧晶典生物技術(shù)有限公司農(nóng)業(yè)項(xiàng)目部任永紅總監(jiān)。
會(huì)議開始，賈繼增研究員做了“小麥高密度SNP芯片的開發(fā)和應(yīng)用”的學(xué)術(shù)報(bào)告。報(bào)告重點(diǎn)介紹了具有自主知識產(chǎn)權(quán)的小麥660K SNP芯片研制思路及進(jìn)展，并與美國、法國和英國此前均推出的不同規(guī)格的SNP芯片進(jìn)行了比較。由博奧晶典與賈繼增課題組合作開發(fā)的小麥660K高密度SNP芯片，已經(jīng)在全國主要小麥研究單位得到廣泛使用，徹底改變了分子標(biāo)記完全依賴國外的局面。該芯片具有通量高，多態(tài)性高，標(biāo)記密度高，分布均勻，分辨率高，自動(dòng)化程度高，基因組信息清楚，應(yīng)用范圍廣等諸多優(yōu)點(diǎn)，可以應(yīng)用于建立高密度遺傳連鎖圖，基因精細(xì)作圖與基因克隆，種質(zhì)資源多樣性與基因組育種平臺(tái)構(gòu)建，小麥族分類與比較基因組研究等研究和應(yīng)用方向。
徐云碧研究員做了“分子植物育種：機(jī)遇與挑戰(zhàn)”的學(xué)術(shù)報(bào)告。報(bào)告從我國面臨的糧食安全問題挑戰(zhàn)入手，提出產(chǎn)量潛力的提高和產(chǎn)量差的縮小依賴于各種現(xiàn)代育種方法、綜合農(nóng)藝措施、社會(huì)經(jīng)濟(jì)制度，而分子育種將發(fā)揮重要的作用。接下來，通過遺傳變異捕獲與選擇、環(huán)境變異檢測與控制、復(fù)雜性狀遺傳改良、育種方法綜合應(yīng)用等方面的詳細(xì)分析，介紹了分子育種的機(jī)遇與挑戰(zhàn)。其中，Envirotyping（環(huán)境型鑒定）概念的提出，引起與會(huì)學(xué)者極大的興趣。最后介紹了玉米55KSNP芯片的開發(fā)過程和芯片特點(diǎn)，此芯片適用于種質(zhì)資源指紋圖譜分析，基因初步和精細(xì)定位，特別適合于溫?zé)釒в衩兹后w，分子標(biāo)記輔助的回交育種、基因累加、輪回選擇，全基因組選擇，溫?zé)釒в衩兹后w的全基因組關(guān)聯(lián)初步分析等。
王文生副研究員做了“3000水稻基因組項(xiàng)目與綠色超級稻育種技術(shù)”的報(bào)告。報(bào)告指出，我國糧食生產(chǎn)現(xiàn)狀不容樂觀，亟待通過“第二次綠色革命”將“高投入，高產(chǎn)，污染環(huán)境”轉(zhuǎn)變?yōu)椤吧偻度?、多產(chǎn)出、保護(hù)環(huán)境”，并培育出在較低的（肥、水和農(nóng)藥）投入條件下能夠高產(chǎn)、穩(wěn)產(chǎn)的“綠色超級稻”。報(bào)告還詳細(xì)介紹了基于3000水稻基因組項(xiàng)目設(shè)計(jì)開發(fā)水稻全基因組高密度55K芯片的思路和過程。水稻全基因組高密度55K芯片的多態(tài)性高，具有10-25K的多態(tài)性標(biāo)記。SNP位點(diǎn)在染色體上間距平均值為6.84K，中位值為5.3K。多樣性SNP標(biāo)記及可用SNP標(biāo)記（包括PolyHighResolution, MonoHighResolution, OTV）比例非常高，占芯片總位點(diǎn)的86.6%。
關(guān)于大豆的SNP芯片開發(fā)項(xiàng)目，中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所田志喜研究員，南京農(nóng)業(yè)大學(xué)作物遺傳育種國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室喻德躍教授，分別以“基因組在大豆育種中應(yīng)用的一些思考”和“大豆高通量355 K NJAU SoySNP芯片的開發(fā)和利用”為主題進(jìn)行了專題報(bào)告。
田志喜研究員在其報(bào)告中指出，大豆是重要的糧食和油料作物，但目前中國已由大豆原產(chǎn)國和產(chǎn)豆大國轉(zhuǎn)變?yōu)槭澜缟献畲蟮拇蠖惯M(jìn)口國，大豆危機(jī)已經(jīng)影響到我國的糧食安全。因此，需要采用基因組合功能基因組研究方法，對影響大豆產(chǎn)量和品質(zhì)的網(wǎng)絡(luò)調(diào)控系統(tǒng)進(jìn)行系統(tǒng)分析，揭示調(diào)控大豆種子發(fā)育、植株形態(tài)建成以及品質(zhì)形成的內(nèi)在機(jī)制，促進(jìn)大豆分子育種研究。并在報(bào)告中簡要介紹了大豆SNP芯片的開發(fā)思路。
喻德躍教授則重點(diǎn)介紹了NJAU 355 K SoySNP芯片的開發(fā)思路和應(yīng)用領(lǐng)域。NJAU 355 KSoySNP芯片代表性強(qiáng)，SNP位點(diǎn)來自于野生和栽培大豆SNP數(shù)據(jù)庫，代表大豆野生和栽培群體的多樣性信息。應(yīng)用性強(qiáng)，可用于大豆群體多樣性分析及功能基因發(fā)掘。準(zhǔn)確性高，355 K SNP標(biāo)記是在600多萬個(gè)SNP根據(jù)嚴(yán)格標(biāo)準(zhǔn)篩選獲得的。標(biāo)記分布均勻，標(biāo)記均勻覆蓋大豆20條染色體，93.6% SNP標(biāo)記間隔小于9 kb，標(biāo)記間的平均物理距離為3.3 kb。自動(dòng)化，大豆355 K SNP芯片基于Affymetrix GeneTitan基因芯片分析系統(tǒng)品臺(tái)，完全自動(dòng)化讀取數(shù)據(jù)，不需要人工校正結(jié)果，避免人為誤差，準(zhǔn)確高效。可以應(yīng)用于大豆種質(zhì)資源基因型鑒定、品種鑒定、遺傳多樣性分析，大豆農(nóng)藝性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）研究，功能基因/QTL定位與克隆，大豆分子設(shè)計(jì)育種（分子標(biāo)記輔助選擇、全基因組選擇育種等）等。
Affymetrix產(chǎn)品經(jīng)理王錢潔博士受邀發(fā)表了“Affymetrix 的‘思考’”主題報(bào)告，系統(tǒng)解讀了Affymetrix 農(nóng)業(yè)基因組解決方案，包括Affymetrix的農(nóng)業(yè)基因組研究策略，Affymetrix Genotyping解決方案，現(xiàn)有的22款用于不同物種研究目錄芯片，用于定制芯片的Axiom篩選+設(shè)計(jì)的流程，和Axiom Analysis Suite。并詳細(xì)介紹了Affymetrix的Eureka Assay平臺(tái)和應(yīng)用，以及最新推出的Axiom 微生物組芯片。
最后，來自博奧晶典生命科學(xué)服務(wù)部主任秦文彥博士和農(nóng)業(yè)項(xiàng)目部總監(jiān)任永紅女士則分別介紹了博奧晶典引進(jìn)的10X Genomics 大片段建庫分析平臺(tái)和擁有自主知識產(chǎn)權(quán)的微流控芯片在農(nóng)業(yè)領(lǐng)域的應(yīng)用介紹。
秦文彥主任介紹，10X平臺(tái)的核心優(yōu)勢是使用大于50 kb長度的基因組DNA構(gòu)建測序文庫，克服了二代測序無法準(zhǔn)確獲得大的結(jié)構(gòu)信息的缺點(diǎn)，同時(shí)又避免了三代測序準(zhǔn)確性低和價(jià)格昂貴的缺點(diǎn)，將高質(zhì)量測序、獲取大片段結(jié)構(gòu)信息和低成本完美的結(jié)合到一起。使用10X平臺(tái)構(gòu)建測序文庫，在育種方面具有的優(yōu)勢包括：基因組de novo組裝：構(gòu)建遺傳圖譜，提高組裝質(zhì)量，降低成本；大尺度遺傳特征：拷貝數(shù)變異和結(jié)構(gòu)變異，提高檢測精度；受單體型調(diào)控的性狀研究：增加復(fù)雜性狀的分析能力，檢測多個(gè)目標(biāo)基因在一條染色體上聚集狀態(tài)；微小變異檢測：SNV & Indel檢測，GWAS研究等。經(jīng)濟(jì)型、實(shí)用型平臺(tái)，實(shí)現(xiàn)準(zhǔn)確可靠、快速簡單、低成本的分子檢測鑒定。
任永紅總監(jiān)從微流控技術(shù)出發(fā)，整體介紹了博奧晶典的微流控產(chǎn)品以及取得的成果。并詳細(xì)介紹了博奧晶典推出的具有中國自主知識產(chǎn)權(quán)的微流控SNP芯片檢測系統(tǒng)，這是一個(gè)經(jīng)濟(jì)型、實(shí)用型的平臺(tái)，能夠?qū)崿F(xiàn)準(zhǔn)確可靠、快速簡單、低成本的分子標(biāo)記檢測，目前在該平臺(tái)已經(jīng)進(jìn)行了人、奶牛、玉米和綿羊的SNP分型檢測，取得了很好的結(jié)果。博奧晶典希望把微流控SNP芯片檢測系統(tǒng)打造成為一把利器，促進(jìn)農(nóng)業(yè)育種效率與效益的提升，實(shí)現(xiàn)品種審定、品種權(quán)保護(hù)、多環(huán)節(jié)全方位市場監(jiān)控。同時(shí)可以從上游的標(biāo)記開發(fā)到下游的生產(chǎn)應(yīng)用，為廣大工作者提供整體解決方案，成為“公益性基礎(chǔ)研究”向“商業(yè)化育種”轉(zhuǎn)化應(yīng)用的橋梁，在多個(gè)層面開展廣泛合作，真正推動(dòng)“產(chǎn)學(xué)研用”一體化。
經(jīng)過一天的學(xué)術(shù)交流，與會(huì)專家對分子育種領(lǐng)域的熱點(diǎn)問題展開了討論并提出了建設(shè)性意見。各位參會(huì)嘉賓表示通過這次會(huì)議進(jìn)一步了解了育種領(lǐng)域的新技術(shù)和新進(jìn)展，同時(shí)與業(yè)內(nèi)頂級學(xué)者面對面的進(jìn)行了交流，對于自身的科研方向有了很多新的啟發(fā)，收獲頗豐！糧食問題關(guān)乎國家安全，種業(yè)發(fā)展是解決糧食問題的根本驅(qū)動(dòng)力，國家以及各大部委都對種業(yè)發(fā)展都給予了極大的關(guān)注與支持，博奧晶典在后續(xù)的發(fā)展中將持續(xù)為中國的種業(yè)發(fā)展貢獻(xiàn)出自己的一份力量。感謝所有的參會(huì)嘉賓的溝通聆聽，下一屆博奧晶典分子育種創(chuàng)新論壇期待您的參與！
北京博奧晶典生物技術(shù)有限公司是博奧生物集團(tuán)有限公司暨生物芯片北京國家工程研究中心的核心子公司。以自主研發(fā)的生物芯片技術(shù)平臺(tái)為主，以引進(jìn)轉(zhuǎn)化吸收各類國際領(lǐng)先技術(shù)平臺(tái)為輔，立足新一代生物檢測技術(shù)（芯片、測序、多重PCR、質(zhì)譜、細(xì)胞分檢等技術(shù)），向國內(nèi)外生命科學(xué)研究、醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)、分子育種、農(nóng)林畜牧、新藥研發(fā)和食品安全領(lǐng)域提供儀器設(shè)備、配套試劑耗材、科研服務(wù)外包、實(shí)驗(yàn)整體解決方案等，系列產(chǎn)品和服務(wù)已出口北美、歐洲、亞洲等30 個(gè)國家和地區(qū)。
博奧晶典始終立足于科研一線，涉及臨床醫(yī)學(xué)、農(nóng)業(yè)育種、食品安全、科學(xué)儀器設(shè)備等領(lǐng)域，擁有完善的產(chǎn)、學(xué)、研技術(shù)與人才體系。截至2016年7月，在科研服務(wù)方向共支持客戶發(fā)表SCI 文章1340多篇，影響因子累計(jì)超過6100分。
測序中國作為本次大會(huì)獨(dú)家媒體支持，會(huì)后對博奧晶典總裁許俊泉先生進(jìn)行了獨(dú)家專訪，后續(xù)的專訪視頻即將出爐，請大家持續(xù)關(guān)注我們獲取后續(xù)的精彩報(bào)道吧！
