? ? ? ? 日前,由北京博奧晶典生物技術(shù)有限公司(以下稱“博奧晶典”)主辦的“單細(xì)胞測序技術(shù)應(yīng)用培訓(xùn)班”在上海圓滿落幕。來自全國各地近百位老師參加了此次培訓(xùn),現(xiàn)場座無虛席。此次培訓(xùn)課程根據(jù)老師們的實(shí)際需求進(jìn)行了優(yōu)化,增加了植物單細(xì)胞消化經(jīng)驗(yàn)分享及數(shù)據(jù)分析思路、單細(xì)胞Loupe可視化軟件個(gè)性化操作及高級分析軟件的應(yīng)用等內(nèi)容,旨在傳遞單細(xì)胞測序最新最熱的研究內(nèi)容。
培訓(xùn)現(xiàn)場盛況
博奧晶典科研服務(wù)事業(yè)部產(chǎn)品講師
? ? ? ? 本次培訓(xùn),各位講師介紹了10x Genomics單細(xì)胞測序平臺及BD Rhapsody單細(xì)胞平臺的相關(guān)技術(shù),包括10x Genomics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序、10x Genomics單細(xì)胞免疫組庫測序、10x Genomics單細(xì)胞ATAC、細(xì)胞表面蛋白及空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù),以及BD單細(xì)胞WTA檢測、TTA檢測、混樣及細(xì)胞表面蛋白檢測技術(shù)。從平臺介紹及常用研究工具分享到高分及重點(diǎn)應(yīng)用案例解析,讓大家對單細(xì)胞測序技術(shù)有一個(gè)更全面的了解,參加培訓(xùn)的老師們都表現(xiàn)出濃厚的興趣。
培訓(xùn)班亮點(diǎn)
? ? ? ? 本次培訓(xùn)有幸邀請到了發(fā)表在Molecular Plant雜志上的國內(nèi)首篇植物單細(xì)胞文章共同一作,中科院植物生理生態(tài)研究所張?zhí)炱娌┦亢托熘薷┦俊?/span>
張?zhí)炱娌┦?/span>
? ? ? ? 張?zhí)炱娌┦吭@中國科協(xié)青年人才托舉工程、中國博士后創(chuàng)新人才支持計(jì)劃、Sanofi-SIBS青年人才獎學(xué)金等資助。具有豐富的植物單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn)。多篇研究論文以第一作者發(fā)表在Plant Cell和Molecular Plant學(xué)術(shù)期刊上。此次報(bào)告,張?zhí)炱娌┦酷槍λ鳛楣餐蛔靼l(fā)表的國內(nèi)首篇植物單細(xì)胞文章做了詳細(xì)介紹,并對實(shí)驗(yàn)的研究背景、設(shè)計(jì)思路、實(shí)驗(yàn)方案的實(shí)施以及實(shí)驗(yàn)開展期間發(fā)現(xiàn)的問題和解決方案做了細(xì)致分享,老師們紛紛表示受益匪淺。
徐洲更博士
? ? ? ? 徐洲更博士主要研究植物基因組和單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組。從3年前開始在簡書和微信公眾號上發(fā)表關(guān)于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的內(nèi)容,目前文章總閱讀次數(shù)近百萬。出于個(gè)人對生物信息的熱愛,獨(dú)立在一個(gè)實(shí)驗(yàn)室搭建了生物信息學(xué)分析平臺。此次報(bào)告,徐洲更博士針對他作為共同一作發(fā)表的國內(nèi)首篇植物單細(xì)胞文章的數(shù)據(jù)分析及常用生物信息學(xué)軟件做了詳細(xì)介紹,解決了大家在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析過程中存在的許多困惑。徐洲更博士風(fēng)趣幽默的表達(dá)方式也為培訓(xùn)班增添了更多活力。
博奧晶典測序平臺技術(shù)總監(jiān)劉杰博士
? ? ? ? 博奧晶典測序平臺技術(shù)總監(jiān)劉杰博士為大家?guī)砹藛渭?xì)胞懸浮液制備和計(jì)數(shù)經(jīng)驗(yàn)分享。包括不同組織單細(xì)胞懸浮液的制備以及如何保證更穩(wěn)定的細(xì)胞產(chǎn)出,并一一解答了各位老師在前處理過程中遇到的問題,讓老師們對樣品制備的重要性有了更清晰的認(rèn)識。
博奧晶典生物信息工程師彭巖博士
? ? ? ? 博奧晶典生物信息工程師彭巖博士,為各位老師帶來了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析思路及常用軟件的介紹和實(shí)操訓(xùn)練。包括Loupe可視化軟件的個(gè)性化操作,單細(xì)胞高級數(shù)據(jù)分析軟件操作以及互作網(wǎng)絡(luò)圖的繪制等。幫助各位老師更好的進(jìn)行后續(xù)數(shù)據(jù)挖掘,以期滿足不同研究方向的個(gè)性化科研需求。
博奧晶典希望通過這一天的培訓(xùn)
對各位老師今后的科研學(xué)習(xí)有所幫助
同時(shí)博奧晶典誠邀更多的老師參與到培訓(xùn)中來
在這里收獲滿滿、快樂滿滿
本次培訓(xùn)班完美落幕
感謝老師們的參與和支持
培訓(xùn)班合影
培訓(xùn)班現(xiàn)場互動討論
? ? ? ? 本次培訓(xùn)沒有報(bào)上名的老師不用桑心,如果想要學(xué)習(xí)單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)下機(jī)后常用的分群軟件Cell ranger、多樣品比較分析軟件AGGR的操作流程以及操作中的注意事項(xiàng);結(jié)果可視化軟件loupe可以實(shí)現(xiàn)的功能及操作流程;以及一些常用的數(shù)據(jù)挖掘R包和軟件,如:擬時(shí)間序列分析、細(xì)胞互作分析及不同樣品相同亞群間如何進(jìn)行差異比較分析等。歡迎參加6月29日在北京舉辦的“第二屆單細(xì)胞測序技術(shù)高端研討會”。
延伸閱讀
? ? ? ? 博奧晶典作為國內(nèi)第一批引進(jìn)10x Genomics平臺的公司,率先在國內(nèi)開展上萬級通量的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)。目前已經(jīng)完成了2000多個(gè)樣品、100多種不同樣品類型的服務(wù),覆蓋的物種和樣品類型包括人和小鼠的肝臟、肺臟、皮膚、心臟、腦、腎臟、血液、卵巢、神經(jīng),以及雞、斑馬魚、豬、水稻、擬南芥、油菜、白菜、橄欖等,是目前國內(nèi)大規(guī)模單細(xì)胞測序經(jīng)驗(yàn)豐富的公司。
? ? ? ??博奧晶典于2018年9月與BD(中國)成立單細(xì)胞研究聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室,致力于大規(guī)模單細(xì)胞測序產(chǎn)品的開發(fā)和打磨,目前可開展如下單細(xì)胞測序產(chǎn)品和服務(wù)。