全國唯一 | 博奧晶典空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)榮獲CSP官方認證
日期:2020-09-15 來源:

       日前,北京博奧晶典生物技術(shù)有限公司空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)榮獲10x Genomics公司頒發(fā)的CSP證書,這是繼單細胞轉(zhuǎn)錄組測序、單細胞ATAC測序技術(shù)、單細胞免疫組庫之后博奧晶典獲得的又一官方認證,是全國唯一一家同時擁有四種10x平臺測序技術(shù)官方認證的服務(wù)商。

       作為國內(nèi)首批引進10x Genomics單細胞平臺的公司,博奧晶典擁有系統(tǒng)完善的單細胞測序服務(wù)平臺,涵蓋了單細胞轉(zhuǎn)錄組、空間轉(zhuǎn)錄組測序、單細胞免疫組庫、單細胞ATAC、單細胞蛋白等多種分子水平的單細胞服務(wù)實驗。涉及的研究領(lǐng)域包括腫瘤、免疫、發(fā)育、神經(jīng)、再生等。

單細胞轉(zhuǎn)錄組測序

       單細胞轉(zhuǎn)錄組測序可以在單細胞水平分析基因表達,研究細胞的異質(zhì)性,定義細胞類型,識別細胞狀態(tài),探索新的細胞亞群和稀有細胞群,具有廣泛的應(yīng)用潛力。

圖1 細胞分群圖(左) 圖2 擬時間序列圖(右)

空間轉(zhuǎn)錄組測序

       空間轉(zhuǎn)錄組測序可以從一片完整的冰凍組織切片中獲取切片不同位置細胞中的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),其基因表達的位置信息對于理解組織功能和病理變化具有重要的意義,尤其在腫瘤研究、免疫研究、發(fā)育生物學(xué)、腦神經(jīng)學(xué)、病理研究等方面極為重要,可應(yīng)用于多領(lǐng)域研究多種組織空間基因表達的高新技術(shù)。

圖3 組織切面空間分群可視化結(jié)果

單細胞免疫組庫測序

       單細胞免疫組庫作為探索生物體免疫細胞多樣性變化的技術(shù),可探索腫瘤免疫微環(huán)境,識別和抵御身體外部的入侵者,描述腫瘤發(fā)生機制,輔助免疫治療;探索自身免疫疾病和炎癥性疾病機制,輔助疫苗研究;揭示器官移植帶來的排斥反應(yīng),為排異藥物研究提供幫助,是腫瘤和免疫疾病研究的有力工具。

圖4 B細胞克隆型注釋(左) 圖5 多樣本比較分析(右)

單細胞ATAC測序

       單細胞ATAC作為表觀遺傳學(xué)研究技術(shù)手段,可用于繪制單細胞基因組染色質(zhì)開放區(qū)的圖譜,在單細胞水平研究基因調(diào)控區(qū)。結(jié)合單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)探索基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控機制,進一步闡述生物現(xiàn)象發(fā)生變化的原因。

圖6 細胞群預(yù)測(左) 圖7 轉(zhuǎn)錄調(diào)控機制(右)

單細胞蛋白測序

       單細胞蛋白測序技術(shù)可以同時獲得單細胞層面的蛋白和基因表達信息。由于基因與蛋白的表達不一致,了解基因調(diào)控和單細胞異質(zhì)性需要有關(guān)RNA和蛋白表達的信息。利用單細胞轉(zhuǎn)錄組+蛋白組進行多維組學(xué)研究,不僅可以提高解析度,而且兩個維度相互驗證,使實驗結(jié)果更具說服力。

圖8 單細胞蛋白實驗原理

       在單細胞領(lǐng)域,博奧晶典目前已完成4000多個樣品、100多種不同樣品類型的服務(wù),覆蓋的物種和樣品類型包括人和小鼠的肝臟、肺臟、皮膚、心臟、腦、腎臟、血液、卵巢、神經(jīng),以及雞、斑馬魚、豬、水稻、擬南芥、油菜、白菜、橄欖等,是目前國內(nèi)大規(guī)模單細胞測序經(jīng)驗豐富的公司。且已累計支持客戶發(fā)表單細胞高分文章21篇,影響因子291.627分,是目前國內(nèi)支持發(fā)文最多、累計影響因子最高的公司。

博奧晶典支持發(fā)表單細胞測序文章(部分)

博奧晶典目前可開展以下單細胞測序產(chǎn)品和服務(wù):