墨卓單細(xì)胞ChIP測序
一、產(chǎn)品介紹
本試劑盒通過抗體和 Tn5 酶識別蛋白與 DNA 的結(jié)合位點(diǎn),并靶向切割 DNA 分子?；谝旱挝⒘骺丶夹g(shù)將經(jīng)過處理的單個細(xì)胞包裹形成油包水結(jié)構(gòu)，并借助帶有細(xì)胞標(biāo)簽的微球捕獲 DNà 片段和標(biāo)記 DNA 分子，實(shí)現(xiàn)蛋白與 DNA 位點(diǎn)結(jié)合的測序，具有高通量、超高分辨率、超強(qiáng)特異性的特點(diǎn)。目前提供的檢測抗體：可選5種組蛋白修飾：H3K27ac、H3K4me1、H3K4me3、H3K27me3、H3K36me3；1種DNA結(jié)合蛋白：Rpb1（RNA聚合酶 Ⅱ）
三、產(chǎn)品優(yōu)勢
1、數(shù)據(jù)可靠，質(zhì)量穩(wěn)定
· K562細(xì)胞樣本測試，抗體使用H3K27ac
· DNA片段捕獲水平可達(dá)2000+
2、技術(shù)前沿，性能出色
· 人PBMC樣本
· 抗體位點(diǎn)H3K4mel，H3K4me3，H3K27me3，H3K27ac
3、分群精準(zhǔn)，相互映射
· 單細(xì)胞ChIP-seq能實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)的分群
· 與 bulk ChlP-seq能相互印證與單細(xì)胞RNA-seq數(shù)據(jù)能完美映射
4、多種抗體，靈活選擇
· 已驗(yàn)證6大常用抗體，可滿足70%研究需求：
· 5種組蛋白修飾：H3K27ac、H3K4me1、H3K4me3、H3K27me3、H3K36me3；
· 1種DNA結(jié)合蛋白：Rpb1（RNA聚合酶 Ⅱ）
· 個性定制
· 提供抗體驗(yàn)證解決方案，可滿足個性化科研需求
四、應(yīng)用案例
1、利用單細(xì)胞ChIP-seq解析腫瘤耐藥機(jī)制
化療和靶向治療的耐藥性的出現(xiàn)是癌癥治療的一個主要挑戰(zhàn)，單細(xì)胞RNA-seq將細(xì)胞分為7類細(xì)胞亞群，發(fā)現(xiàn)非耐藥細(xì)胞中有一個細(xì)胞亞群具有耐藥潛能。單細(xì)胞ChIP-seq揭示H3K27me3的缺失導(dǎo)致耐藥性基因的激活并找出了耐藥性腫瘤細(xì)胞的發(fā)育進(jìn)程。
Grosselin K, et al. Nat Genet.2019.
數(shù)據(jù)表明樣本共分為4類細(xì)胞亞群，其中復(fù)發(fā)腫瘤細(xì)胞T1亞群占比最高，該群細(xì)胞H3K27me3的信號弱并且細(xì)胞干性相關(guān)的基因活躍，具有向其他細(xì)胞類群發(fā)育的潛力。
Steven J.Wu, et al.nature biotechnology.2021
